單位定義：

• 一個單位的 TGIRT ® -III 逆轉(zhuǎn)錄酶 (RT) 活性是使用 poly(rA)/oligo(dT) 42作為底物在 60°C 下在 1 分鐘內(nèi)聚合 1 nmole dNTP 所需的酶量。

酶濃度：

• 200 單位/微升

酶儲存緩沖液：

• 20 mM Tris-HCl (pH 7.5)、500 mM KCl、1 mM EDTA、1 mM DTT、50% 甘油

酶特性和新活性：

• 比逆轉(zhuǎn)錄病毒逆轉(zhuǎn)錄酶具有更高的熱穩(wěn)定性、持續(xù)合成能力和保真度，允許從高度結(jié)構(gòu)化或高度修飾的 RNA （例如 tRNA）和包含富含 GC 重復(fù)擴(kuò)增的 RNA合成全長、端到端的 cDNA 。1-9,12,15,18

• 新型端到端模板轉(zhuǎn)換活動，可在逆轉(zhuǎn)錄過程中連接 RNA-seq 或 PCR 接頭，無需單獨的 RNA 3'-接頭連接步驟。1這種模板轉(zhuǎn)換活動極大地促進(jìn)了鏈特異性 RNA-seq 文庫的構(gòu)建，與使用隨機(jī)六聚體引物或使用 RNA 連接酶進(jìn)行接頭連接的程序相比，偏差更小。1,7,8

• 從退火引物高效合成 cDNA。退火引物的預(yù)測 T m應(yīng)大于 60 o C。建議將酶與反應(yīng)混合物中的底物在室溫下預(yù)孵育 30 分鐘，并通過添加 dNTP 開始反應(yīng)。新應(yīng)用的最佳條件應(yīng)通過測試 25 至 450 mM NaCl 的鹽濃度范圍來確定。

酶的建議用途：

1. 全面的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組分析。8

2. 全細(xì)胞、外泌體、血漿和其他無細(xì)胞 RNA 的 RNA-seq。7、8、15

3. miRNA、tRNA 和其他小的非編碼 RNA 的分析。1-9,12,15

4. RIP-seq、HITS-CLIP、irCLIP 和 CRAC，??用于表征 RNA-蛋白質(zhì)相互作用和核糖體分析。1,10,11

5. 通過高通量測序鑒定 RNA 堿基修飾。4、5、13、14

6. 使用 SHAPE 和 DMS 修飾等方法進(jìn)行全基因組或靶向 RNA 結(jié)構(gòu)映射。1,16

7. 富含 GC 的重復(fù)擴(kuò)增的逆轉(zhuǎn)錄和定量。18

8. 長 cDNA 的合成。1

9. RT-qPCR。1

10. 單鏈 DNA 序列。17

11. FFPE腫瘤樣本分析（咨詢InGex技術(shù)支持）。

酵素的優(yōu)點：

1. 全面的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組分析。

與非鏈特異性 TruSeq v2 相當(dāng)且優(yōu)于鏈特異性 Tru-Seq v3，TGIRT®-seq 的 ribodepleted、碎片化通用人類參考 RNA 樣本概括了人類轉(zhuǎn)錄本和摻入的相對豐度。TGIRT®-seq 明顯比 TruSeq v3 更具鏈特異性，并消除了 TruSeq 固有的隨機(jī)六聚體引發(fā)的采樣偏差。與 TruSeq 相比，TGIRT®-seq 顯示出更均勻的 5' 到 3' 基因覆蓋并識別出更多的剪接點。TGIRT®-seq 能夠同時分析同一 RNA-seq 中的 mRNA 和 lncRNA 作為結(jié)構(gòu)化的小 ncRNA，包括 TruSeq 數(shù)據(jù)集中基本上不存在的 tRNA。8

2. 全細(xì)胞、外泌體、血漿和其他細(xì)胞外 RNA 的 RNA-seq。

快速處理時間（通過 PCR 步驟構(gòu)建 RNA-seq 文庫<5 小時）；需要少量 RNA（低 ng 范圍）；全面的轉(zhuǎn)錄譜，包括 mRNA 和 lncRNA 以及小 ncRNA，包括 tRNA、pre-miRNA 和其他結(jié)構(gòu)化小 ncRNA 的全長讀數(shù)；比傳統(tǒng)方法更少的偏見和更高的鏈特異性。7、8、15

3. 在 RIP-seq、HITS-CLIP、irCLIP、CRAC、核糖體分析等方法中，通過 TGIRT® 模板切換構(gòu)建 RNA-seq 文庫。

快速處理時間（通過 PCR 步驟構(gòu)建 RNA-seq 文庫<5 小時）；需要少量 RNA（低 ng 范圍）；不需要 RNA 連接酶，程序中的步驟更少，偏差更小，效率更高。1,10,11

4. 比逆轉(zhuǎn)錄病毒 RT 具有更高的熱穩(wěn)定性、持續(xù)合成能力和鏈置換活性。

• 使用錨定 oligo(dT) 引物構(gòu)建多腺苷酸化 RNA 的 RNA-seq 文庫，其 5' 到 3' 覆蓋率比沒有核消耗步驟的逆轉(zhuǎn)錄病毒 RT 更均勻。1
• 通過毛細(xì)管電泳的基于的方法狀或DMS結(jié)構(gòu)映射以使RNA結(jié)構(gòu)映射顯著升onger閱讀長度和過早停止比逆轉(zhuǎn)錄病毒RT更少。1,16
• 能夠分析包含富含 GC 的重復(fù)擴(kuò)增的 RNA 模板。18
• 能夠從 tRNA 和其他小型結(jié)構(gòu)化/修飾的 ncRNA 合成全長、端到端的 cDNA，這些 ncRNA 對逆轉(zhuǎn)錄病毒 RT 無效。4-9,12-15     

5. 人血漿和大腸桿菌 基因組DNA 的ssDNA-seq 。

通過直接在 DNA 鏈的 3' 末端啟動 DNA 合成，同時連接 DNA-seq 接頭，無需末端修復(fù)、拖尾或連接，從而以更簡單的工作流程捕獲精確的 DNA 末端。能夠分析核小體定位、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點、DNA 甲基化位點和起源組織。17